做核磁共振的副作用主要会出现惊恐感、耳鸣、过敏等，核磁共振检查的安全性相对来说也是比较高的，只有部分患者可能会出现一些副作用。

1、惊恐感：核磁共振在检查的过程中会产生比较大的噪音，有部分患者有可能会对噪音比较敏感，有可能会产生一种恐惧的心理。

2、耳鸣：如果长时间待在噪音的环境当中，有可能会出现短暂性的听力受损，还有可能会出现耳鸣的症状。

3、过敏：在做核磁共振检查的时候需要使用造影剂，有部分人群很可能会对造影剂产生过敏，从而导致出现皮肤红肿和瘙痒的症状。

除此之外，对于安装心脏起搏器的患者，有可能会导致起搏器和心脏造成损伤。