大肠埃希菌染色后呈短杆状，个别菌体呈近似球杆状或长丝状。大肠杆菌可以通过革兰氏染色而变成红色或粉色。

动物肠道正常寄居菌是大肠杆菌，在某些情况下，只有极少数能引起疾病。胃肠道感染主要是由于感染了胃肠道，导致RT或动物胃肠道感染，而大肠杆菌除了引起胃肠道感染外，还可引起尿道感染、关节炎、脑膜炎、败血型感染等。

大肠埃希菌是一种细菌，属于原核生物，其细胞壁由肽聚糖组成，仅含核糖体简单，无核无拟核，常被用于基因工程中的运载体。大肠埃希菌的代谢类型为异养兼厌氧型，在培养基中不需添加生长因子，在培养基中加入伊红亚甲蓝，遇大肠埃希菌呈深紫色，且有金属光泽，可以鉴别大肠杆菌是否存在。